Un equipo de investigadores ha desarrollado un nuevo software que facilita el diseño de cajas moleculares para la encapsulación de fármacos. Denominado CageCavityCalc -C3- su desarrollo ha sido posible gracias al Instituto de Reconocimiento Molecular y Desarrollo Tecnológico (IDM) de la Universitat Politècnica de València (UPV) y la Universidad de Oxford.
En concreto, la nueva herramienta permite calcular de forma automatizada y visualizar el tamaño de la cavidad de cajas moleculares utilizadas en aplicaciones biológicas y que se emplean, por ejemplo, para la administración de fármacos anticancerígenos.
"El software CageCavityCalc usa un algoritmo novedoso que permite el cálculo del tamaño de la cavidad de cajas moleculares y de propiedades como la hidrofobicidad y el potencial electrostático, lo que proporciona información clave para optimizar el diseño de la caja molecular que albergan los fármacos, para su posterior liberación en el organismo de la forma más eficiente posible", explica Vicente Martí Centelles.
"El software CageCavityCalc usa un algoritmo novedoso que permite el cálculo del tamaño de la cavidad de cajas moleculares y de propiedades como la hidrofobicidad y el potencial electrostático"
Las cajas moleculares también son usadas en otras aplicaciones como sensores o reconocimiento molecular. Para que puedan funcionar de forma óptima, la clave está en su cavidad interna, que debe ser capaz de encapsular moléculas huésped y modular sus propiedades. "Sin embargo, hoy en día, el diseño de cajas con propiedades específicas es un desafío y el desarrollo de software que ayude a predecir las propiedades es fundamental. Y a este desafío responde nuestro trabajo", destaca el especialista.
De acuerdo con el investigador del IDM, hasta ahora el cálculo de propiedades moleculares y cavidades requiere el uso de software basado en "línea de comandos" y realizar ajustes de parámetros por parte del usuario. Mientras, CageCavityCalc tiene una interfaz gráfica que permite a los no especialistas utilizar esta herramienta sin necesidad de tener conocimientos de programación informática.
El cálculo de la cavidad, además, está totalmente automatizado, lo que evita la necesidad de realizar ajustes de parámetros para realizar el cálculo. "La principal ventaja del software CageCavityCalc es su eficiencia y fácil uso, además de ser gratuito y de código abierto. Agiliza los cálculos de la cavidad, facilitando así el desarrollo de nuevas cajas moleculares funcionales, con las propiedades adecuadas para sus diferentes aplicaciones. En definitiva, simplifica mucho el diseño de estas cajas, optimizando al mismo tiempo su funcionamiento", concluye Vicente Martí Centelles.