Está surgiendo evidencia de que la vitamina D, y posiblemente las vitaminas K y A, podrían ayudar a combatir la COVID-19. Un nuevo estudio de la Universidad de Bristol publicado en la revista Angewandte Chemie de la Sociedad Química Alemana ha demostrado cómo podrían funcionar ellos, y otros medicamentos antivirales. La investigación indica que estos suplementos y compuestos dietéticos podrían unirse a la proteína de pico viral y, por lo tanto, podrían reducir la infectividad del coronavirus SARS-CoV-2. Por el contrario, el colesterol puede aumentar la infectividad, lo que podría explicar por qué tener colesterol alto se considera un factor de riesgo de enfermedad grave.
Recientemente, los investigadores de Bristol demostraron que el ácido linoleico se une a un sitio específico en la proteína del pico viral y que, al hacerlo, bloquea el pico en una forma cerrada y menos infecciosa. Ahora, un equipo de investigación ha utilizado métodos computacionales para buscar otros compuestos que podrían tener el mismo efecto, como tratamientos potenciales. Esperan evitar que las células humanas se infecten impidiendo que la proteína del pico viral se abra lo suficiente para interactuar con una proteína humana (ACE2).
Los nuevos medicamentos antivirales pueden tardar años en diseñarse, desarrollarse y probarse, por lo que los investigadores buscaron en una biblioteca de medicamentos y vitaminas aprobados para identificar aquellos que podrían unirse a este 'bolsillo farmacológico' descubierto recientemente dentro de la proteína de pico SARS-CoV-2 .
El colesterol puede aumentar la infectividad, lo que podría explicar por qué tener colesterol alto se considera un factor de riesgo de enfermedad grave
El equipo estudió primero los efectos del ácido linoleico en el pico, utilizando simulaciones computacionales para demostrar que estabiliza la forma cerrada. Simulaciones posteriores mostraron que la dexametasona, que es un tratamiento eficaz para COVID-19, también podría unirse a este sitio y ayudar a reducir la infectividad viral además de sus efectos sobre el sistema inmunológico humano.
Luego, el equipo realizó simulaciones para ver qué otros compuestos se unen al sitio del ácido graso. Esto identificó algunos medicamentos que se han encontrado mediante experimentos que son activos contra el virus, lo que sugiere que este puede ser un mecanismo por el cual previenen la replicación viral, como bloquear la estructura de la espiga de la misma manera que el ácido linoleico.
Los hallazgos sugirieron varios candidatos a fármacos entre los componentes farmacéuticos y dietéticos disponibles, incluidos algunos que se ha encontrado que ralentizan la reproducción del SARS-CoV-2 en el laboratorio. Estos tienen el potencial de unirse a la proteína de pico SARS-CoV-2 y pueden ayudar a prevenir la entrada de células.
Las simulaciones también predijeron que las vitaminas solubles en grasa D, K y A se unen al pico de la misma manera, lo que hace que el pico sea menos capaz de infectar las células.
La Dra. Deborah Shoemark, investigadora asociada senior (Modelado Biomolecular) en la Escuela de Bioquímica, quien modeló el pico, explicó: "Nuestros hallazgos ayudan a explicar cómo algunas vitaminas pueden desempeñar un papel más directo en la lucha contra la COVID que su apoyo convencional al sistema inmunológico humano".
"Nuestros hallazgos ayudan a explicar cómo algunas vitaminas pueden desempeñar un papel más directo en la lucha contra la COVID"
"La obesidad es un factor de riesgo importante para la COVID grave. La vitamina D es soluble en grasa y tiende a acumularse en el tejido graso. Esto puede reducir la cantidad de vitamina D disponible para las personas obesas. Los países en los que algunas de estas deficiencias de vitaminas son más comunes también han sufrido mucho durante el curso de la pandemia. Nuestra investigación sugiere que algunas vitaminas y ácidos grasos esenciales, incluido el ácido linoleico, pueden contribuir a impedir la interacción pico / ACE2. La deficiencia en cualquiera de ellos puede facilitar la infección del virus".
Los niveles de colesterol alto preexistentes se han asociado con un mayor riesgo de COVID-19 grave. Los informes de que la proteína pico del SARS-CoV-2 se une al colesterol llevaron al equipo a investigar si podría unirse en el sitio de unión de los ácidos grasos. Sus simulaciones indican que podría unirse, pero que puede tener un efecto desestabilizador sobre la conformación bloqueada de la espiga y favorecer la conformación abierta, más infecciosa.
El Dr. Shoemark continuó: "Sabemos que el uso de estatinas reductoras del colesterol reduce el riesgo de desarrollar COVID grave y acorta el tiempo de recuperación en casos menos graves. Ya sea que el colesterol desestabilice la conformación cerrada "benigna" o no, nuestros resultados sugieren que por interactuación directamente con el pico, el virus podría secuestrar el colesterol para alcanzar las concentraciones locales requeridas para facilitar la entrada celular y esto también puede explicar la pérdida observada de colesterol circulante después de la infección ".
El profesor Adrian Mulholland, de la Escuela de Química de Bristol, agregó: "Nuestras simulaciones muestran cómo algunas moléculas que se unen en el sitio del ácido linoleico afectan la dinámica del pico y lo bloquean. También muestran que los medicamentos y vitaminas activos contra el virus pueden funcionar en el mismo. Apuntar a este ámbito puede ser una ruta hacia nuevos medicamentos antivirales. Un próximo paso sería observar los efectos de los suplementos dietéticos y probar la replicación viral en las células".
Alison Derbenwick Miller, vicepresidenta de Oracle para la investigación, dijo: "Es increíblemente emocionante que los investigadores estén obteniendo nuevos conocimientos sobre cómo el SARS-CoV-2 interactúa con las células humanas, lo que finalmente conducirá a nuevas formas de combatir el COVID-19. Encantado de que la infraestructura en la nube de alto rendimiento de Oracle esté ayudando a promover este tipo de investigación que cambia el mundo. El crecimiento de una comunidad globalmente conectada de investigadores basados en la nube es exactamente lo que Oracle for Research está diseñado para hacer ".
El equipo incluyó a expertos de Bristol UNCOVER Group, incluidas las Escuelas de Química, Bioquímica, Medicina Celular y Molecular de Bristol, y el Centro Max Planck de Bristol para Biología Mínima y el Centro de Biología Sintética de Bristol, utilizando las computadoras de alto rendimiento de Bristol y la supercomputadora del Reino Unido, ARCHER, como así como la computación en la nube de Oracle. El estudio fue apoyado por subvenciones del EPSRC y el BBSRC.