El Ministerio de Sanidad ha publicado una nueva actualización sobre la situación de las variantes del SARS-CoV-2 en España. La variante Ómicron (B.1.1.529) continúa siendo la dominante en España, a través de sus cinco linajes (BA.1, BA.2, BA.3, BA.4 y BA.5) y los sublinajes de estos.
En estos momentos, aunque a nivel global, BA.5 y los linajes derivados de este se mantienen sin cambios importantes y son dominantes tanto en nuestro país como en el resto del mundo, se han detectado numerosos linajes con mutaciones que podrían relacionarse con un mayor escape a la respuesta cuya prevalencia está creciendo.
El hecho de que compartan una o varias mutaciones clave indica que, muy probablemente, son fruto de la presión selectiva ejercida por los niveles actuales de inmunidad en la población. Entre ellos destacan algunos con pocas diferencias, pero que se han detectado en niveles significativos como son BA.4.6 o BF.7. También se han identificado otros en porcentajes mucho menores, pero con muchas más diferencias en su perfil de mutaciones respecto a los linajes dominantes que, in vitro, demuestran una capacidad mayor de evasión de la respuesta inmune.
Entre estos destacan: BA.2.3.20, BA.2.75.2, CA.1, BR.2, BN.1, BM.1.1.1, BU.1, BQ.1, BQ.1.1, y XBB. Los únicos de ellos que se han detectado hasta ahora en porcentajes superiores al uno por ciento en España son BA.4.6 y BF.7.
Mediante secuenciación de muestras aleatorias, en la semana 43 de 2022 (24 a 30 de de octubre) el porcentaje de Ómicron se sitúa en 100%. Los linajes predominantes son los derivados de BA.5
El 20 de octubre de 2022, el Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades (ECDC, por sus siglas en inglés) designó el linaje BQ.1 y sus sublinajes, incluyendo BQ.1.1, como variantes de interés. De acuerdo con su prevalencia actual y su ritmo de crecimiento, se estima que estos linajes superarán el 50% en Europa a finales de noviembre o principios de diciembre. Las mutaciones que definen estos linajes se han relacionado con el grado de evasión a la respuesta inmune y por el momento no existen indicios de que ninguno de estos linajes se relacione con una mayor gravedad de los casos.
Mediante secuenciación de muestras aleatorias, en la semana 43 de 2022 (24 a 30 de de octubre) el porcentaje de Ómicron se sitúa en 100%. Los linajes predominantes son los derivados de BA.5. Entre los linajes con mutaciones clave en la espícula adicionales a las de BA.4/5 o BA.2, en la semana 43, los linajes BQ.1 y derivados de este, incluyendo BQ.1.1, que han demostrado un rápido ritmo de crecimiento en otros países europeos, suponen el 27,1% y BF.7 se sitúa en el 16,7%.
Los cribados aleatorios mediante PCR específica en las comunidades autónomas que han cribado un número de muestras superior a 30 en la semana 44 (31de octubre a 6 de noviembre) han detectado, para los linajes BA.4 y BA.5 porcentajes que oscilan entre el 88,5 y el 98,9% y para el linaje BA.2, porcentajes entre el cero y el 9,7%. En los análisis en aguas residuales, se encontró un predominio de BA.3/BA.4/BA.5 a nivel nacional.