El Ministerio de Sanidad ha publicado una nueva actualización del informe sobre la situación de las variantes del SARS-CoV-2 en España. La variante Ómicron (B.129.1.1, detectada originalmente en Sudáfrica) continúa siendo la dominante. Esta comprende cinco linajes (BA.1, BA.2, BA.3, BA.4 y BA.5) y los sublinajes derivados de estos.
En estos momentos, aunque a nivel global, BA.5 y los linajes derivados de este sin cambios importantes siguen siendo dominantes en España y en el mundo, se han detectado numerosos linajes con mutaciones que podrían relacionarse con un mayor escape a la respuesta cuya prevalencia está creciendo.
Los cribados aleatorios mediante PCR específica en las comunidades autónomas que han cribado un número de muestras superior a 30 en la semana 41 (10 a 16 de octubre) han detectado, para los linajes BA.4 y BA.5 porcentajes que oscilan entre el 88,3 y el 100%, y para el linaje BA.2, porcentajes entre el cero y el 5,7%. En los análisis en aguas residuales, se encontró un predominio de BA.3/BA.4/BA.5 a nivel nacional.
Retomando los linajes con mutaciones relacionadas con un mayor escape inmunitario que están aumentando su presencia, el hecho de que compartan una o varias mutaciones clave indica que, muy probablemente, son fruto de la presión selectiva ejercida por los niveles actuales de inmunidad en la población. Entre ellos destacan algunos con pocas diferencias pero que se han detectado en niveles significativos como son BA.4.6 o BF.7.
El 20 de octubre de 2022, el ECDC designó el linaje BQ.1 y sus sublinajes, incluyendo BQ.1.1, como variantes de interés
Otros, detectados en porcentajes mucho menores, pero con muchas más diferencias en su perfil de mutaciones respecto a los linajes dominantes que, in vitro, demuestran una capacidad mayor de evasión de la respuesta inmune (desarrollada por infección previa, vacuna, infección de brecha o anticuerpos monoclonales). Entre estos destacan: BA.2.3.20, BA.2.75.2, CA.1, BR.2, BN.1, BM.1.1.1, BU.1, BQ.1, BQ.1.1, y XBB.
El 20 de octubre de 2022, el Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades (ECDC, por sus siglas en inglés), designó el linaje BQ.1 y sus sublinajes, incluyendo BQ.1.1, como variantes de interés.
De acuerdo con su prevalencia actual y su ritmo de crecimiento, se estima que estos linajes superarán el 50% en Europa a finales de noviembre o principios de diciembre, alcanzando el 80% para principios de enero de 2023. Las mutaciones que definen estos linajes se han relacionado con el grado de evasión a la respuesta inmune y por el momento no existen indicios de que ninguno de estos linajes se relacione con una mayor gravedad de los casos. En este informe se recogen las primeras detecciones de estos linajes en España.
En la semana 39 (del 3 al 9 de octubre) el linaje BQ.1.1 supone el 3,6% de los casos secuenciados aleatoriamente en España.