El informe de variantes de Sanidad incorpora por primera vez el análisis de las aguas residuales

Por primera vez, el informe sobre la situación epidemiológica de las variantes del SARS-CoV-2 en España ha aportado datos de las aguas residuales. Por el momento, los subvariantes B.4 y B.5 son los predominantes.

Micrografía de viriones de SARS CoV 2 (Foto. EP)
6 septiembre 2022 | 15:15 h

El Ministerio de Sanidad ha publicado este martes una nueva actualización sobre la situación epidemiológica de las variantes del SARS-CoV-2 en España. Según el documento, la variante Ómicron (B.1.1.529, detectada originalmente en Sudáfrica) continúa siendo la dominante en España. Comprendida en cinco linajes (BA.1, BA.2, BA.3, BA.4 y BA.5) y los sublinajes derivados de éstos, el linaje dominante en España es BA.5 desde el mes de junio, coincidiendo igualmente con el aumento de la incidencia.

Esta variante, comprende cinco linajes (BA.1, BA.2, BA.3, BA.4 y BA.5) y los sublinajes derivados de estos. BA.1 fue el linaje mayoritario durante la primera fase de expansión y, por tanto, las características descritas para la variante se corresponden con las de este linaje. BA.2, que presenta numerosas diferencias respecto a BA.1, fue aumentando hasta convertirse en el linaje predominante a nivel global desde marzo hasta junio de 2022. Por

Sin embargo, a lo largo de los últimos dos meses, los linajes BA.2.12.1BA.4 y BA.5, que han mostrado una ventaja de crecimiento sobre BA.2, han ido aumentando progresivamente su prevalencia a nivel global.

En este contexto, esta última actualización del documento, mediante secuenciación de muestras aleatorias, en la última semana el porcentaje de Ómicronse sitúa en 100%.

Esta última actualización del documento, mediante secuenciación de muestras aleatorias, en la última semana el porcentaje de Ómicron se sitúa en 100%

En cuanto a los cribados aleatorios mediante PCR específica para los linajes BA.4 y BA.5 han detectado en la semana 34 de 2022 (22-28 de agosto) porcentajes que oscilan en las diferentes CCAA entre el 83,4% y el 100%. Esta misma semana, para el linaje BA.2, se encuentra entre el 0% y el 8%.

Mediante secuenciación de muestras aleatorias, en la semana 33 de 2022 (14 a 21 de agosto) el porcentaje de Ómicron se sitúa en entre el 74,5% y el 100%  en las comunidades autónomas, mientras que en esta última semana (22-28 de agosto) los porcentajes oscilan entre el 90,1% y el 100%. A continuación se muestra el caso de casos secuenciados desde el inicio del verano:

  • 6 de septiembre: 1.359
  • 29 de agosto: 1.356
  • 22 de agosto: 1.969
  • 16 de agosto: 2.620
  • 8 de agosto:3.597 (Sin Murcia)
  • 1 de agosto: 4.826
  • 27 de julio:  6.103 (Sin Murcia)
  • 18 de julio:  7.686
  • 11 de julio: 8.593 (Sin Castilla-La Mancha)
  • 4 de julio: 7.578
  • 27 de junio: 5.693 (Sin Comunidad Valenciana)

Durante el mes de julio, las cifras se secuenciaron, llegando su máximo a 8.593 (11 de julio). Sin embargo, la última actualización muestra un aumento de 3 casos secuenciados respecto número de la semana anterior, posicionándose en 1.359 el 6 de septiembre.

En esta misma semana, el porcentaje promedio de muestras secuenciadas de las que se dispone de información en Sistema de Vigilancia en España (SiViEs), sobre el total de casos detectados en España, ha sido del 1,6%, oscilando entre 1,1% y 2,2%.

ANÁLISIS DE LAS AGUAS RESIDUALES

Por primera vez, el documento muestra la nformación derivada del análisis de aguas residuales. En la semana del 21 al 27 de agosto de 2022, la variante Ómicron se detecta en las 54 estaciones depuradoras de aguas residuales (EDAR) que participan en el proyecto VATar-COVID-19.

Asimismo, los resultados mostraron un predominio de las subvariantes BA.3/BA.4/BA.5. En concreto, la mutación presente en los nuevos sublinajes BA.3, BA.4 y BA.5, se ha detectado en las 54 EDAR analizadas mientras que la mutación BA.2 está presente en en 35 EDAR. Por último, el sublinaje BA.1 de la variante Ómicron, no se ha detectado en ninguna de las EDAR.

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